ELIXIR za boljšo uporabo informacij in podatkov za raziskave
Ob polnopravni pridružitvi Slovenije infrastrukturi ELIXIR bo v torek, 20. septembra 2016, v Cankarjevem domu v Ljubljani, potekalo slavnostno odprtje slovenskega vozlišča ELIXIR-SI z naslovom ‘Podatki za življenje’. Otvoritev bo potekala vzporedno z znanstvenim simpozijem ob 11. obletnici Centra za funkcijsko genomiko in biočipe CFGBC, ki bo 21. septembra 2016, na Medicinski fakulteti Univerze v Ljubljani. ELIXIR združuje zmogljivosti vodilnih evropskih raziskovalnih organizacij z namenom povečevanja skupnih zmogljivosti za varno in dolgotrajno upravljanje s podatki, ki se pridobijo v okviru raziskav, financiranih z javnimi sredstvi.
Z objavo konzorcijske pogodbe ELIXIR1 je Slovenija februarja 2016 izpolnila vse pogoje za polnopravno članstvo v prednostni evropski raziskovalni infrastrukturi za informacije s področja ved o življenju ELIXIR2. Infrastruktura ELIXIR je porazdeljena infrastruktura za informacije s področja ved o življenju. Organizirana je kot mreža evropskih vozlišč, ki jo sestavlja središče ELIXIR s sedežem v Angliji, ter trenutno 20 vozlišč ELIXIR iz 19 evropskih držav in ena država opazovalka. ELIXIR združuje zmogljivosti vodilnih evropskih organizacij z namenom povečevanja skupnih zmogljivosti za varno in dolgotrajno upravljanje s podatki, ki se pridobijo v okviru raziskav, financiranih z javnimi sredstvi. Koordinira, združuje in vzdržuje bioinformatska orodja in storitve v državah članicah in preko tega omogoča akademskim organizacijam in industriji za njihove raziskave (lažji) dostop do zanje življenjsko pomembnih (1) podatkov, (2) orodij, (3) standardov, (4) informacijsko komunikacijskih storitev in virov ter (5) virov za promocijo, izobraževanje in usposabljanje v smislu dela s podatki ved o življenju.
Vozlišče ELIXIR Slovenija3 (ELIXIR-SI) koordinira Medicinska fakulteta Univerze v Ljubljani. Pobudnik priključitve je bil Center za funkcijsko genomiko in biočipe (CFGBC), sedaj pa vozlišče sestavlja 15 raziskovalnih skupin iz 12 organizacij. Vizija ELIXIR-SI je vzpostavitev nacionalne infrastrukture za osrednje nacionalno podatkovno vozlišče. Služilo bo optimalnemu standardnemu in dolgotrajnemu upravljanju obsežnih podatkov s področja ved o življenju po načelih FAIR4 in bo komplementarno vpeto v obstoječo nacionalno IKT infrastrukturo (e-infrastrukture, podvojevanje podatkov, uporaba obstoječih računalniških gruč). Del podatkovnega vozlišča so tudi storitve za pomoč vsem raziskovalcem v vedah o življenju, predvsem na področjih usposabljanja, bio(medicinske) informatike, bioinformatskih analiz, podatkovnega rudarjenja in biostatistike. Podatkovno vozlišče bo omogočalo enostavno in standardno izmenjavo podatkov ter souporabo orodij in storitev tudi z vozlišči ELIXIR drugih evropskih držav. Poleg infrastrukture za upravljanje s podatki je potrebno imeti zagotovljeno tudi ustrezno infrastrukturo, ki podatke generira, kot so npr. najzmogljivejše aparature za naslednje generacije sekvenciranja (NGS). Slovenija takšne nacionalne infrastrukture na področju ved o življenju še nima, zato je smiselno združevati aktivnosti pri gradnji infrastrukture za upravljanje s podatki in zmogljivejše infrastrukture za pridobivanje podatkov. S podatkovnim vozliščem ELIXIR-SI in z infrastrukturo naslednjih generacij sekvenciranja bo Slovenija lahko zagotovila ustrezne referenčne genetske podatke o slovenski človeški populaciji, kot tudi rastlinski in živalski biodiverziteti. Tako bo omogočena kakovostnejša posamezniku prilagojena zdravstvena in prehranska oskrba, skrb za ohranjanje okolja ter okolju prijazno in obnovljivo gospodarstvo na vseh področjih, povezanih z biosfero.
